Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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