Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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