Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms