Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms