Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ERVPABLB-1P60509 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ERVPABLB-1P60509 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ERVPABLB-1P60509 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms