Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPREP23469 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPREP23469 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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