Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SDSP20132 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SDSP20132 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SDSP20132 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SDSP20132 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SDSP20132 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SDSP20132 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SDSP20132 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SDSP20132 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SDSP20132 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SDSP20132 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SDSP20132 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms