Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFGEF1Q9Y6D6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms