Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD2APQ9Y5K6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms