Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms