Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
WASHC2CQ9Y4E1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms