Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms