Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms