Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FARSAQ9Y285 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms