Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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