Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms