Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms