Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms