Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms