Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms