Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS7AQ9UBW8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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