Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms