Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CC2D2AQ9P2K1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms