Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHPF2Q9P2E5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms