Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMLHEQ9NVH6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms