Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL1Q9NSC2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL1Q9NSC2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms