Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms