Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms