Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM3Q9NNZ6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms