Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP3Q9H9T3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms