Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms