Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSDMCQ9BYG8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms