Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC8Q9BY41 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms