Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms