Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM42Q9BTD8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms