Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS4Q9BT78 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS4Q9BT78 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms