Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms