Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD1Q99460 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms