Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCNAQ96QF7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNAQ96QF7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms