Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YTHDC1Q96MU7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms