Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms