Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms