Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms