Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALLDQ8WX93 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms