Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD1Q8NHV4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms