Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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