Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYB561D1Q8N8Q1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms