Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC84Q86UT8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms