Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R42Q7Z4L9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R42Q7Z4L9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms