Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD1L3Q7Z443 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms